Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp25P57080 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp25P57080 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp25P57080 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp25P57080 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp25P57080 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp25P57080 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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