Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd38P56528 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd38P56528 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms