Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Sh3bp1P55194 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Sh3bp1P55194 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Sh3bp1P55194 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Sh3bp1P55194 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms