Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PctpP53808 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PctpP53808 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PctpP53808 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PctpP53808 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PctpP53808 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PctpP53808 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PctpP53808 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PctpP53808 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PctpP53808 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms