Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Opn1swP51491 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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