Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Tsc2-203ENSMUST00000226284 6266 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Defa6P50704 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa6P50704 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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