Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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TspoP50637 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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TspoP50637 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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TspoP50637 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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TspoP50637 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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TspoP50637 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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TspoP50637 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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TspoP50637 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TspoP50637 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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TspoP50637 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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TspoP50637 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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TspoP50637 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TspoP50637 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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