Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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Hoxc13P50207 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Hoxc13P50207 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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Hoxc13P50207 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Hoxc13P50207 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Hoxc13P50207 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Hoxc13P50207 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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