Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrprbP47758 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms