Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms