Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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