Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprmP28828 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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PtprmP28828 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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PtprmP28828 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprmP28828 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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PtprmP28828 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm12961-201ENSMUST00000120507 1050 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm3635-201ENSMUST00000212314 354 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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