Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RxraP28700 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RxraP28700 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RxraP28700 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RxraP28700 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RxraP28700 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
RxraP28700 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
RxraP28700 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
RxraP28700 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RxraP28700 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RxraP28700 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RxraP28700 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RxraP28700 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RxraP28700 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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