Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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Hoxd10P28359 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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