Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Pde6bP23440 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pde6bP23440 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pde6bP23440 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pde6bP23440 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6bP23440 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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