Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms