Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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PdgfaP20033 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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PdgfaP20033 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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PdgfaP20033 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms