Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
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P18530 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
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P18530 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18530 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
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