Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms