Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb1P12658 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb1P12658 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Calb1P12658 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms