Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms