Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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SparcP07214 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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SparcP07214 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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SparcP07214 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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SparcP07214 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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SparcP07214 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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SparcP07214 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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SparcP07214 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SparcP07214 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SparcP07214 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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SparcP07214 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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SparcP07214 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SparcP07214 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SparcP07214 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SparcP07214 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SparcP07214 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SparcP07214 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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SparcP07214 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SparcP07214 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SparcP07214 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SparcP07214 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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SparcP07214 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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