Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms