Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp4O70480 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp4O70480 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp4O70480 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp4O70480 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp4O70480 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vamp4O70480 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp4O70480 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp4O70480 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp4O70480 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp4O70480 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp4O70480 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp4O70480 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp4O70480 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp4O70480 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp4O70480 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp4O70480 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp4O70480 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp4O70480 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp4O70480 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp4O70480 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp4O70480 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp4O70480 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp4O70480 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms