Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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