Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ptpn20O55082 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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