Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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