Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Psmb10O35955 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms