Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Kif1cO35071 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Kif1cO35071 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Kif1cO35071 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Kif1cO35071 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif1cO35071 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms