Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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