Protein–RNA interactions for Protein: O08992

Sdcbp, Syntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdcbpO08992 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms