Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms