Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8005F6YKY3 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms