Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CenpfE9Q3P4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CenpfE9Q3P4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms