Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

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Length 752 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Susd1E9Q3H4 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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