Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myo5cE9Q1F5 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms