Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc1E9Q043 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms