Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BC048679D3YXE9 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms