Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmf1B9EKI3 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms