Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Syce3B5KM66 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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