Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brpf1B2RRD7 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms