Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn7aB1AYL1 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms