Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Trabd2bB1ATG9 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Trabd2bB1ATG9 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Trabd2bB1ATG9 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Trabd2bB1ATG9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Trabd2bB1ATG9 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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Trabd2bB1ATG9 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trabd2bB1ATG9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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