Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtf1A2AQ19 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms