Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syndig1A2ANU3 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.7 ms