Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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