Protein–RNA interactions for Protein: A2A9K7

Cnksr1, Connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnksr1A2A9K7 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnksr1A2A9K7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnksr1A2A9K7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms