Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms