Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms