Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm17190V9GX38 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm17190V9GX38 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm17190V9GX38 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm17190V9GX38 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm17190V9GX38 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm17190V9GX38 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm17190V9GX38 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm17190V9GX38 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm17190V9GX38 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm17190V9GX38 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm17190V9GX38 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm17190V9GX38 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17190V9GX38 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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